1927年1月，国民革命军总司令部在南昌召开军事会议，制定了肃清长江下游的作战方案：先浙江、淞沪，消灭孙传芳主力，然后合攻南京。随后，东路何应钦主力由赣东和闽北进攻浙江，主攻杭州、上海；中路蒋介石由赣北入皖南，以为东路军策应，李宗仁由鄂东出皖北，阻击奉系直鲁军；西路唐生智在固守武汉的同时进军河南，控制京汉线南段；另设预备队于南昌、九江，策应全局。此外，冯玉祥的西北军也奉命由陇海路出洛阳、郑州，与豫南革命军相呼应，相机击破吴佩孚的主力。

1月初，东路北伐军入浙后与孙传芳部首战于富阳，激战数日，因浙军实力强大，北伐军不得已退至衢州。接着，浙军追击，将衢州包围，并向宁波推进。1月17日，北伐军增兵，准备反击，东路军前敌总指挥白崇禧也赶到衢州；2月初，北伐军迅速推进，势如破竹，于18日攻入杭州，次日占领绍兴，先锋部队已达嘉兴，上海遥遥在望。为了挽救危在旦夕的孙传芳，直鲁军派重兵分赴上海、松江、南京、镇江等地助战，3月初与北伐军接战。这时，北伐军正在执行分路进攻，合围上海的计划；14日，北伐军占领溧阳，至20日又夺取了常州、丹阳等地，切断了上海与南京的联系。接着，北伐军一路进攻上海，一路进攻松江，于21日夺占松江，打开上海之门户；随后，北伐军相继占领龙华、苏州、进抵梅家街、吴淞，完成了对上海的四面合围。3月23日，白崇禧率部进入上海。

在北伐东路军进攻沪宁和沪杭线的同时，中路江右、江左军也在安徽展开攻势。江右军在程潜的指挥下，自九江出发向安徽边界进攻，不战而进芜湖，后又攻克当涂、丹阳等地，击溃驻守的直鲁军。江左军由李宗仁指挥从鄂东向安庆进击，占领合肥、寿州、六安、蚌埠等重要城市。

中路北伐军平定安徽大部后，南京已经处在江右军和江左军的三面包围之中了。3月20日，程潜命包围南京的各部队向南京外围各据点发起猛攻，经数日激战，陆续攻克南京周边城镇，直逼南京近郊；随后，何应钦所率东路军也到达镇江。23日，程潜下令总攻南京，当天即突入南京城，孙军与直鲁军仓惶溃逃，北伐军于27日胜利占领南京。至此，国民革命军基本控制了东南五省和上海、南京，孙传芳的军队大体上被消灭。

回过头再说说吴佩孚。1926年9月汉阳失守后，吴佩孚退到信阳，打算在这里调兵反攻。当时，河南全境有十余万军队名义上归吴佩孚指挥，但军心涣散且缺粮少车，战斗力和机动力都很差。驻守河南的直系将领靳云鹗以河南最高军事首长自居，下令凡通过其防区的杂牌军队，一律予以缴械；9月16日，吴佩孚卫队经过，被靳云鹗的部下黄殿臣不分清红皂白的予以缴械，吴佩孚闻讯大怒，勒令逮捕黄殿臣枪决，结果当晚信阳附近发生兵变，吴佩孚仓皇自信阳搭乘三等火车逃奔郑州。

就在吴佩孚走投无路之际，直系要员请出了在保定闲居的为人宽厚、颇有人缘的曹锟，希望他能亲自出马团结直系。9月27日，曹锟来到郑州，劝吴佩孚不要自大狂妄，造成直系离心离德，而应开诚对下，有容人之量，同时也要靳云鹗顾全大局。这一时期，奉系张作霖也频频给吴佩孚拍电报，提出如果吴佩孚对付不了革命军，奉系愿意出兵，并由吴佩孚指挥。虽然张作霖满口吴二哥、吴二哥的叫，热乎的不得了，但形势比人强，此时的吴佩孚已被奉军视为挡路的瘟神了。一直只担心国民革命军出武胜关继续北伐的吴佩孚做梦都没想到奉军渡河南下了，保定方面奉军一再逼迫吴军让防，奉军宣称孙传芳乞援于奉，奉系要负责收复武汉。

1927年1月，已在北京就任安国军总司令的张作霖下令张学良、张宗昌出兵援吴，先肃清黄河北岸，然后渡河至郑州。2、3月间，奉军大举开进，围攻郑州，吴佩孚坐困愁城，南北两面受敌，不得已于3月15日挥泪离开郑州，退往豫西，为奉军让出了京汉路。不料此时西北冯玉祥已从陕西出动，一路东向，与奉军有一触即发之势，因此奉军再次提出让吴佩孚让防，吴佩孚再次出走，后几经辗转，来到四川。

写到这里，“民国百年（四）：北洋割据时期”就暂告一段落了。当然，必须指出，截至1927年3月底广州国民政府占领南京之时，北洋军阀势力尚未在中国政坛上消失。虽然此时直系吴佩孚、孙传芳两大军阀主力已经基本被消灭，但奉系张作霖依然拥有着非常强大的武装，不但控制着当时的北京政府，而且还占据着中原主要地区，所以，北洋军阀割据时期其实还没有结束，国民革命军的北伐战争也没有完成。我们把“民国百年（四）”这部分终结于这个时间段，是因为我们在下一部分将要介绍南京国民政府统治的最初十年，在这“十年”的头两年里，国民政府完成了北伐，“消灭”了奉系，统一了中国，这才结束了“北洋割据时期”，所以我们将这最后扫尾的部分放在下部分去讲。

正如我在本部分第一篇所说，北洋割据时期起于1916年6月袁世凯死去，皖系当政，终结于1928年底奉系张学良东北易帜。从此以后，中华民国历史结束了“南北两线”时期，南方政府消灭了北洋军阀、取代了北京政府，结束了民国以来长达16年的南北分裂局面。因为自1912年以来南方历届政府、政权均为孙中山所号召，或为孙中山所亲自创立并担任元首，所以我们可以说这一次是“三民主义”统一了中国，孙中山及其追随者虽然在民国初创时便让出了最高统治权给北洋，但16年后他们终于又重新夺了回来。